関西学院大学共同研究（一般研究B） （2009-2010）
「耐熱性逆転写酵素の構築に関する基礎研究」 研究費： \845,000（2009年度）
|主任研究員| 藤原 伸介 （関西学院大学理工学部・教授）
|分担者| 岡田 孝（関西学院大学理工学部・教授） 酵素の基質結合モデリング |
関西学院大学共同研究（一般研究A） （2009）
「内分泌かく乱化学物質の健康影響とその分子メカニズムの解明」 研究費総額：2,151,000円
|主任研究員| 今岡 進 （関西学院大学理工学部・教授）
|分担者| 岡田 孝（関西学院大学理工学部・教授）
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2008年度情報メディア教育センター研究プロジェクト( 2008 )
「授業におけるテキストマイニング の有効性に関する研究」 研究費金額： 50万円
|主任研究員| 岡田 孝（関西学院大学・理工学部・教授）武田 俊之 （関西学院大学・情報メディア教育センター）
|分担者| 武田 俊之 （関西学院大学・情報メディア教育センター）, 黒崎 茂樹（関西学院大学・情報メディア教育センター）, 谷田 薫（関西学院大学・総研）
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独立行政法人新エネルギー・産業技術総合開発機構（NEDO技術開発機構）研究開発委託事業 ( 2007 - 2011 )
「ベイジアンネットによる反復投与毒性推定手法の開発」 総額： 31,358,250円 (内 直接経費25,972,000/間接経費 3,893,000)
委託先：独立行政法人製品評価技術基盤機構化学物質管理センター
「構造活性相関手法による有害性評価手法 / 毒性・代謝知識情報の収集と体系化」
｜プロジェクトリーダー｜林 真 （「国立医薬品食品衛生研究所 安全性生物試験研究センター 変異遺伝部長）
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科学研究費補助金 基盤研究 (A) ( 2006 - 2008 ) 研究代表者
「生理活性群に対する化学構造モチーフ知識ベースの作成」 研究費総額： 42,900,000円
（内 直接経費 33,000,000/ 間接経費 9,900,000)
研究分担者 ｜鷲尾 隆 (大阪大学・産業科学研究所・教授, 2006-2007) , 高橋由雅 (豊橋技術科学大学・工学部・教授,2006-2008）,
沼尾正行（大阪大学・産業科学研究所・教授, 2006）, 藤島悟志（豊橋技科大技術科学大学・工学部・助教, 2007） |
情報メディア教育センター研究プロジェクト ( 2005-2006 ) 研究員
「スポーツ・インフォマティックスの研究」 研究費総額： 1,000,000円
主任研究員｜早藤貴範（関西学院大学理工学部・教授｜
研究員｜中條道雄（関西学院大学・総合政策学部）, 北橋忠広（前 関西学院大学理工学部・教授）, 巳波弘佳（関西学院大学理工学部）, 岡田 孝（関西学院大学理工学部・教授）,
武田俊之（情報メディア教育センター） |
情報メディア教育センター研究プロジェクト ( 2005-2006 ) 研究員
「グリッドコンピューティング環境の構築と評価」 研究費総額： 1,000,000円
主任研究員｜武田俊之（情報メディア教育センター）｜
研究員｜岡田 孝（関西学院大学理工学部・教授）, 地道, 正行
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| 光エネルギー変換研究センター（化学科小山研究室，日本化薬）, ( 2005- ) |
科学研究費補助金 基盤研究 (A) ( 2002 - 2005 ) 研究代表者
「単塩基多型と医薬品化学構造からの高次元データマイニングによる薬効評価」 研究費総額： 25,350,000円
（内 直接経費 19,500,000/
間接経費 5,850,000)
｜研究分担者 ｜ 一石 英一郎 ( 東北大学・未来科学技術共同センター・助教授 ) ,
鷲尾 隆 (大阪大学・産業科学研究所・助教授) , 雄山 真弓 ( 関西学院大学・文学部・教授 ) |
科学研究費補助金 特定領域研究(2) 計画研究 ( 2001 - 2004 ) 研究代表者
「アクティブマイニングによる化学物質群からのリスク分子発見」 研究費総額： 34,200,000円
｜研究分担者 ｜ 雄山 真弓 ( 関西学院大学・文学部・教授 ) , 高橋 由雅 ( 豊橋技術科学大学・
工学部・教授 ) , 加藤 博明 ( 豊橋技術科学大学・工学部・助手 )
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株）デンソーアイティラボラトリ 受託研究 ( 2003 ) 研究代表者
「人間の目を模した、統計的手法によるロバストな画像認識技術の研究」 研究費総額： 150万円
｜研究分担者 ｜ 新妻 弘崇 ( 関西学院大学・理工学部・博士研究員 )
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武田薬品工業（株） 学外共同研究 ( 2003 ) 研究代表者
「P450の各分子種における基質の化学的特性に関する研究」 研究費総額： 100万円
｜研究分担者 ｜ 小此木 研二 ( 薬研究本部・薬物機能第一研究所長 ) , 上口 尚美 ( 薬研究本部・薬物機能第一研究所・主任研究員 |
科費補助金 基盤研究 (B) ( 2000 - 2002 ) 研究分担者
「グラフ構造データマイニング手法とそれに基づく活性部分分子構造同定システム」 研究費総額： 1,210,000円
｜研究代表者 ｜ 鷲尾 隆 (大阪大学・産業 科学研究所・助教授)
｜研究分担者 ｜ 元田 浩 (大阪大学・産業 科学研究所・教授), 堀内 匠 (大阪大学・産業 科学研究所・助手
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